Am besten wäre bis Düsseldorf Hauptbahnhof weiterzufahren und um 03:35 mit der S8 direkt unter das Flughafengebäude fahren.
Die S-Bahn, die bis unter das Flughafenterminal fährt, ist die S11 von/nach Bergisch Gladbach. Eine andere S-Bahn hält an der Haltestelle „Düsseldorf Flughafen Terminal“ nicht.
Ergänzung/Korrektur:
Bebeto66 hat Recht. Es gibt nachts auch eine Fahrt der S8.